克拉瑪依排名第一的大學是新疆第二醫(yī)學院，排名第二的是克拉瑪依職業(yè)技術(shù)學院，以下為具體名單，以供參考。

1、新疆第二醫(yī)學院

新疆第二醫(yī)學院是一所以醫(yī)學為主的大學，新儒家、管理學與其他學科協(xié)調(diào)發(fā)展，公立本科醫(yī)學院校。學院坐落于我國重要的石油石化產(chǎn)業(yè)基地新疆克拉瑪依市，定位為應(yīng)用型高等教育機構(gòu)，主要培養(yǎng)區(qū)域經(jīng)濟社會發(fā)展所需的高素質(zhì)應(yīng)用型人才、技術(shù)技能人才。

原新疆醫(yī)科大學后博學院于2003年5月6日在烏魯木齊市批準成立，2004年2月5日教育部教函[2004]13號確認，由新疆醫(yī)科大學主辦、充分依托學校優(yōu)質(zhì)教育資源和辦學優(yōu)勢建設(shè)和發(fā)展的獨立學院。2012 年 12 月 6 日，克拉瑪依市委市政府與新疆醫(yī)科大學共同簽署合作建設(shè)新疆醫(yī)科大學后博學院協(xié)議。新校區(qū)于2015年9月竣工，學院正式遷址克拉瑪依市。2021年，經(jīng)教育部批準，新疆醫(yī)科大學后博學院劃轉(zhuǎn)新疆第二醫(yī)學院，學校識別碼為4165013560，同時，撤銷新疆醫(yī)科大學后博學院的設(shè)立。

2、克拉瑪依職業(yè)技術(shù)學院

克拉瑪依職業(yè)技術(shù)學院是一所以工科為主的學院、工科與文科相結(jié)合的全國普通高等學校，位于新疆維吾爾自治區(qū)克拉瑪依市，學校是國家示范性高職院校、新疆石油石化職教園區(qū)理事長單位。

克拉瑪依職業(yè)技術(shù)學院的前身是成立于1956年的石油工業(yè)部烏魯木齊石油學校。2000年，升格為高等職業(yè)技術(shù)學院，更名為克拉瑪依職業(yè)技術(shù)學院。2017年8月，學院入選教育部第二批現(xiàn)代學徒制試點單位。